注目ポイントは、現在形か過去形か。
このシーンでは、注文をしているのは「今」なのに、
「よかった（よろしかった）ですか？」と過去形をつかうことに違和感が生じます。

（「昨日のご注文は、こちらでよろしかったでしょうか」のように、
過去のことに対してつかうのであれば問題ありません。）

ちょっとおかしな「よろしかった」の別の例として、
お客さまに席のご案内をする時、「こちらのお席でよろしかったでしょうか」というのも不適切です。
お客さまにまだ聞いていないことに対して、
既に聞いたことのように確認する言い回しですよね。

その場のことを確認するには現在を表す「よい（よろしい）」をつかい、「よろしいでしょうか」とお伝えするのが適切です。
正しい表現で、お客さまに気持ちよく確認していただきましょう。。